Lightroom6をインストールした際に、既存のLightroom5のカタログがアップグレードされているのなら、Lightroom５で使っていたカタログ（新規作成したカタログでは ありません）のフォルダーの中に、カタログファイルが２つありませんでしょうか？
私の場合はこうなっています。
私の場合は中段右のLightroom Catalog.lrcatというのが５からアップグレードされたカタログで、５で管理していたファイルの表示をそのまま受け継いで６で表示しています。
カタログフォルダの中にカタログファイルが２つあったら、アップグレードされた方のカタログファイルをダブルクリックしてみて下さい。
Lightroom６インストール時に、正常にカタログがアップグレードされていれば、ダブルクリック後にLightroom６が起動し、今まで５で表示されていたファイルが表示されるはずで す。