もう一度読み込み作業を行って下さい。
その際に読み込みダイアログでCドライブのマイピクチャーに保存されたフォルダを選びます。
そして、ダイアログ上部の読み込みオプションで「移動」を選び、右パネルで移動先のドライブにEドライブ（の任意の場所）を選びます。
そして読み込みを行うと、CドライブからEドライブにデータが移動します。
移動した後に、LightroomのフォルダパネルにCドライブのフォルダが枚数０として残っているかも知れませんが、フォルダの上で右クリックしてコンテキストメニューから削除すれば消えま す。