外部編集の設定はあまり関係ないと思います。
WindowsしかわかりませんがNik Collectionをインストールすると、以下のフォルダーに該当するファイルが出来ます。
＜ドライブ名>:\users\ユーザー名\AppData\Roaming\Adobe\Lightroom\External Editor Presets
ここに
AnalogEfexPro2.lrtemplate
ColorEfexPro4.lrtemplate
以下合計7つのテンプレートが出来ます。
これが出来ていなければインストールが失敗していると思われます。
一度アンインストールして再インストールしてみてください、その際「対応ホストアプリケーション」の画面でLightroomのテンプレート保存先フォルダーが出るので、そこで、
＜ドライブ名>:\users\ユーザー名\AppData\Roaming\Adobe\Lightroom までのパスが正しく認識されているか確認し、誤っている様なら修正してください。
これで正しくインストール出来ると思います、だめならそのフォルダーへのアクセス権等の問題が考えられると思います。